BIOCHIMICA E BIOLOGIA MOLECOLARE

Anno accademico 2017/2018 - 2° anno
Docenti Crediti: 10
Organizzazione didattica: 250 ore d'impegno totale, 144 di studio individuale, 56 di lezione frontale, 50 di laboratorio
Semestre:
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Obiettivi formativi

  • BIOCHIMICA

    Il corso di Biochimica si propone di fornire agli studenti di medicina le basi per capire i contesti fisico, chimico e biologico in cui si inquadrano molecole, reazioni e vie metaboliche. Il presente corso darà rilievo alle relazioni tra struttura e funzione delle principali classi di macromolecole (carboidrati, i lipidi, le proteine e gli acidi nucleici) ed alla loro regolazione metabolica a livello molecolare e cellulare.

    Al fine di stimolare l'interesse dello studente, i vari argomenti del programma, saranno trattati sottolineando le relative interconnessioni logiche e consequenziali, evidenziando gli aspetti clinici ed introducendo altresi i metodi sperimentali.

    Alla fine del corso lo studente avrà compreso i rapporti struttura-funzione delle principali molecole biologiche, i meccanismi biochimici essenziali per una corretta funzionalità metabolica e le conseguenze delle loro alterazioni.

  • BIOLOGIA MOLECOLARE

    Il corso integrato di Biochimica e biologia molecolare si propone di fornire agli studenti di odontoiatria le basi per capire i contesti fisico, chimico e biologico in cui si inquadrano molecole, reazioni e vie metaboliche; di dare rilievo alle relazioni tra struttura e funzione delle principali classi di macromolecole ed alla regolazione metabolica a livello molecolare e cellulare. Per stimolare l'interesse dello studente i vari argomenti saranno spiegati sottolineando le interconnessioni logiche e consequenziali, evidenziando gli aspetti clinici, introducendo i metodi sperimentali. Alla fine del corso lo studente avrà compreso i rapporti struttura-funzione delle principali molecole biologiche, i meccanismi biochimici essenziali per una corretta funzionalità metabolica e le conseguenze delle loro alterazioni.

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    Consapevolezza che le alterazioni biochimiche e biomolecolari rispecchiano un quadro fisiopatologico e che sono validi indicatori per prevenire, diagnosticare, monitorare e curare lo stato di malattia.

    Conoscenza dei campioni biologici ottenuti dal paziente al fine di estrarne informazioni relative ad eventuali patologie, condizioni metaboliche o caratteristiche biochimico-genetiche utile alla gestione del paziente.

    Consapevolezza della scelta delle metodiche di laboratorio da adottare in maniera opportunità

    Particolare attenzione verrà posta agli aspetti fisiopatologico del cavo orale

    Nell'ambito di questo modulo, complementare al modulo di 2 CFU di biochimica clinica e biologia molecolare molecolare, verranno attenzionate le metodiche molecolari

  • BIOCHIMICA CLINICA

    Consapevolezza che le alterazioni biochimiche e biomolecolari rispecchiano un quadro fisiopatologico e che sono validi indicatori per prevenire, diagnosticare, monitorare e curare lo stato di malattia.

    Conoscenza dei campioni biologici ottenuti dal paziente al fine di estrarne informazioni relative ad eventuali patologie, condizioni metaboliche o caratteristiche biochimico-genetiche utile alla gestione del paziente.

    Consapevolezza della scelta delle metodiche di laboratorio da adottare in maniera opportunità

    Particolare attenzione verrà posta agli aspetti fisiopatologico del cavo orale


Prerequisiti richiesti


Frequenza lezioni

  • BIOCHIMICA

    Frequenza Obbligatoria cosi come previsto dal Regolamento del Corso di Laurea

  • BIOLOGIA MOLECOLARE

    La frequenza del corso è obbligatoria nella misura prevista dal regolamento del corso di studi.

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    Obbligatoria

  • BIOCHIMICA CLINICA

    Obbligatoria


Contenuti del corso

  • BIOLOGIA MOLECOLARE

    GLI ACIDI NUCLEICI: STRUTTURA 1^ - STRUTTURA 2^

    I GENOMI EUCARIOTICI - GENI INTERROTTI –

    LA TRASMISSIONE DELL'INFORMAZIONE GENETICA E LE MOLECOLE DI RNA: Il dogma centrale della biologia e sue modificazioni - il tRNA come adattatore - mRNA: funzione (Batteri ed Eucarioti) - LA REPLICAZIONE: DNApolimerasi

    SINTESI PROTEICA – Ribosomi - Stadi della sintesi proteica - gli inibitori della sintesi proteica

    IL CODICE GENETICO

    LA TRASCRIZIONE – meccanismo e concetti generali - Componenenti dell’unità trascrizionale: Promotore-sito d’inizio-trascritto-terminatore - Importanza della trascrizione nella regolazione dell’espressione genica - Fasi generali della trascrizione

    REGOLAZIONE DELLA TRASCRIZIONE NEI PROCARIOTI - ORGANIZZAZIONE AD OPERONI

    LA TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI : RNA polimerasi - Fattori della Trascrizione

    PROCESSAMENTO DEGLI RNA - Splicing e Splicing alternativo

    REGOLAZIONE DELLA TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI – FATTORI DI TRASCRIZIONE

     

    TECNICHE DI BIOLOGIA MOLECOLARE

    MANIPOLAZIONE DEGLI ACIDI NUCLEICI – elettroforesi - enzimi di restrizione –Southern e Northern blot – sequenziamento del DNA

    VETTORI – Plasmidi – principio e pratica del clonaggio

    PCR – principi del metodo – analisi dei risultati

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    I campioni biologici, estrazione e dosaggio di acidi nucleici e proteine.

    Tecniche di biologia molecolare in laboratorio: Reazione di polimerizzazione a catena (PCR), Applicazioni in campo odontoiatrico della PCR

    Saggi immunoenzimatici (ELISA)

    Sequenziamento I, II, III Materiale fornito durante il corso dalla docente

    Tecnologie Microarrays

    Marcatori Tumorali, tumori del cavo orale

  • BIOCHIMICA CLINICA

    Definizione e ruolo della Medicina di Laboratorio, l’indagine di laboratorio

    I campioni biologici: tipi, prelievi, trattamento e conservazione.

    Il referto biologico: variabilità preanalitica, analitica e post-analitica. Variabilità biologica. Il controllo di qualità. Caratteristiche diagnostiche di un test di laboratorio: la sensibilità diagnostica, la specificità diagnostica, valore predittivo positivo e negativo di un test, la finestra diagnostica.

    Il Fegato, metabolismo, marcatori di lesione epatica.

    Sintesi e catabolismo dell'eme, gli itteri

    Detossificazione da alcol e farmaci. Lipoproteine plasmatiche. Ciclo dell'urea

    Attività metabolica della placca dentale, carie e tartaro

    Metabolismo del Calcio e del fosfato.

    Il Cuore, Marcatori di danno cardiaco, Indagini di laboratorio. Rischio cardiovascolare: aterosclerosi e metabolismo lipidico, Indagini di laboratorio.

    Il Rene: Parametri per la valutazione della funzionalità renale ed esame delle urine.

    L'esame emocromocitometrico, VES


Testi di riferimento

  • BIOCHIMICA

    1. Siliprandi-Tettamanti. Biochimica Medica. Piccin.
    2. Nelson Cox. I principi di Biochimica di Lehninger. Zanichelli

  • BIOLOGIA MOLECOLARE

    Lewin, B., et al, Il Gene, edizione compatta, Zanichelli, 2011

    Watson, J.D. et al., Biologia Molecolare del gene VII ed., Zanichelli 2015

     

    Ottimi riassunti degli argomenti da trattare sono anche reperibili nei capitoli finali di buoni libri di Biochimica, quali ad esempio:

    Nelson & Cox, I principi di Biochimica di Lehninger, Zanichelli 2010

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Biologia del cavo orale. Istologia, biochimica, fisiologia, David B. Ferguson, CE, 4) Lavori scientifici e materiale didattico fornito dalla docente del corso

  • BIOCHIMICA CLINICA

    1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 2)Biologia del cavo orale. Istologia, biochimica, fisiologia, David B. Ferguson, CEA; 3)Biochimica medica strutturale metabolica e funzionale, Noris Siliprandi,Guido Tettamanti, Piccin-Nuova Li 4)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 5)Corsi-video online


Programmazione del corso

BIOCHIMICA
 *ArgomentiRiferimenti testi
1*PROTEINE: composizione e struttura 
2*PROTEINE DEL TESSUTO CONNETTIVO 
3*PROTEINE DEL PLASMA Assorbimento, trasporto e riserve di ferro. Distribuzione del ferro nell'organismo umano. Immunoglobuline. Aspetti biochimici della coagulazione del sangue 
4*ENZIMI E CINETICA ENZIMATICA. Catalisi enzimatica. Cinetica enzimatica. Allosterismo. Regolazione dell’attività enzimatica.  
5*COENZIMI UTILIZZATI NELLE REAZIONI METABOLICHE. 
6*BIOENERGETICA E OSSIDAZIONI BIOLOGICHE. Genoma mitocondriale. Richiami di termodinamica chimica. Trasporto di ioni e metabolíti attraverso la membrana mitocondriale interna. Coenzimi piridin-nucleotidici. Richiami di elettrochimica. Catena mitocondriale di trasporto degli elettroni. Fosforilazione ossidativa. Trasporto di ioni e metaboliti nei mitocondri. 
7*RADICALI LIBERI Definizione; effetti dei radicali liberi nei sistemi biologici; perossidazione dei lipidi insaturi ed alterazioni delle membrane biologiche; prodotti di riduzione parziale dell'ossigeno (anione superossido, acqua ossigenata e radicale idrossile). 
8*EMOGLOBINA E TRASPORTO DELL’OSSIGENO Struttura funzioni dell’emoglobina. Vari tipi di emoglobine. Curva di dissociazione dell’emoglobina: effetto cooperativo - effetto Bohr, 2,3 DPG. Trasporto isoidrico della CO2. Tamponi emoglobinici. Effetto Hamburger (scambio dei cloroioni). Emoglobinopatie. 
9*METABOLISMO DEI GLUCIDI. Glicidi di importanza biologica: glicogeno, amido, disaccaridi. Funzione plastica ed energetica del glicidi. Digestione ed assorbimento dei glucidi. Amilasi e disaccaridasi. Meccanismi di trasporto e di assorbimento dei glicidi. Assorbimento intestinale del glucosio, carrier mobile per il glucosio. Utilizzazione del glucosio. 
10*METABOLISMO DEI GLUCIDI, GLUCONEOGENESI; CONTROLLO DEL GLUCOSIO EMATICO Glicogeno sintesi e glicogeno lisi: Regolazione del metabolismo del glicogeno epatico e muscolare. Disturbi del metabolismo del glicogeno, le glicogenosi. Gluconeogenesi e regolazione (enzima tandem). Regolazione della glicemia: Meccanismo d'azione dell'adrenalina e del glucagone. 
11*METABOLISMO DEI GLUCIDI, GLUCONEOGENESI; CONTROLLO DEL GLUCOSIO EMATICO Adrenalina: recettori alfa e beta adrenergici. Effetti. metabolici mediati dai suddetti recettori. Nucleotidi ciclici (AMP ciclico e GMIP ciclico).  
12*METABOLISMO DEI GLUCIDI; CONTROLLO DEL GLUCOSIO EMATICO Gli ormoni glucocorticoidi e loro meccanismo d'azione . Insulina: biosintesi, meccanismo di secrezione e suoi effetti metabolici. Recettori insulinici. Processo d’internalizzazione dell'insulina Meccanismo molecolare d'azione dell’insulina a livello della membrana plasmatica, a livello citoplasmatico e nucleare. Effetti metabolici dell'insulina sul metabolismo glicidico, lipidico, proteico e acidi nucleici. 
13*LA GLICOLISI E L'OSSIDAZIONE DEL PIRUVATO Glicolisi aerobica ed anaerobica e loro regolazione metabolica ed ormonale: Utilizzazione dell'energia nella glicolisi. Origine dell’acido lattico. Lattico deidrogenasi (LDH) ed enzimi pendolari Fermentazione alcolica. Interconversione dei monosaccaridi. Utilizzazione metabolica dell'acido piruvico e sue interconversioni metaboliche, correlazioni tra metabolismo glicidico, lipidico e proteico. Enzima malico. 
14*LA GLICOLISI E L'OSSIDAZIONE DEL PIRUVATO Decarbossilazione ossidativa dell'acido piruvico: Difosfotiamina, acido lipoico, coenzima A. Regolazione del metabolismo dell'acido piruvico (complesso multienzimatico della piruvato deidrogenasi). 
15*SHUNT DELL'ESOSOMONOFOSFATO La via dei pentosi (o Shunt dell'esosomonofosfato) Ruolo del NADPH nel metabolismo. 
16*CICLO D KREBS Il ciclo degli acidi tricarbossilici o ciclo di Krebs e sua regolazione metabolica ed ormonale. Correlazioni metaboliche tra alcuni intermedi del ciclo di Krebs e i metaboliti della sintesi dei lipidi.Ciclo piruvato-citrato e correlazioni con il ciclo extramitocondriale del citrato. Reazione globale e resa energetica del Ciclo di Krebs. Ruolo biosintetico dei Ciclo. Reazioni anaplerotiche. Localizzazione mitocondriale degli enzimi. 
17*METABOLISMO LIPIDICO Lipidi di importanza biologica (trigliceridi, fosfolipidi, cerebrosidi, ecc.). Digestione ed assorbimento dei lipidi. Lipoproteine plasmatiche. Beta Ossidazione degli acidi grassi e bilancio energetico. Sistema di trasporto degli acidi grassi attivati. Carnitina. Chetogenesi ed utilizzazione extraepatica dei corpi chetonici. Chetoacidosi diabetica. Biosintesi degli acidi grassi saturi ed insaturi. 
18*METABOLISMO LIPIDICO Regolazione metabolica ed ormonale della biosintesi degli acidi grassi. Biosintesi del colesterolo e sua regolazione. Patologie connesse al metabolismo del colesterolo. Ipercolesterolemia familiare. Aterosclerosi. Obesità. 
19*ORMONI Struttura, classificazione e cenni sulla biosintesi. Aspetti biochimici dei meccanismi molecolari dell'azione degli ormoni. Introduzione al metabolismo. Le vie metaboliche. Meccanismi di trasduzione del segnale nei diversi organi e tessuti. Proteine G. Secondi Messaggeri (cAMP, cGMP, Calcio, ecc.). Il ciclo dei fosfoinositidi. Fospatidil-inositolo 4,5 Bifosfato, IP3 e DAG. Meccanismo d’azione degli ormoni cAMP dipendenti.  
20*ORMONI Ormoni che regolano la calcemia (Paratormone e Calcitonina) e Vitamina D3. Adrenalina, Glucagone, ACTH, ecc. Meccanismo d’azione degli ormoni steroidei. Mineralcorticoidi, glucocorticoidi ed ormoni sessuali. Fattori di crescita Insulina e recettori tirosin -chinasici. Insulina e glucagone e loro recettori. Diabete mellito di primo e di secondo tipo. 
21*REGOLAZIONE DELL’EQUILIBRIO IDROSALINO: Elettroliti sodio, potassio calcio. Pompa sodio-potassio. Aldosterone. Sistema Renina-Angiotensina. Regolazione pressione osmotica negli organismi viventi. Ruolo del rene nell’omeostasi. Meccanismi di formazione dell’urina. ADH. Osmocettori ipotalamici. Diabete insipito. Meccanismo di moltiplicazione in controcorrente. 
22*REGOLAZIONE DELL’EQUILIBRIO ACIDO-BASE: Equazione di Handerson e Hasselbach. Sistemi tamponi plasmatici ed eritrocitari. Scaambio isoidrico della CO2. Effetto Hamburger. Regolazione dell’equilibrio acido-base renale. Modificazioni dell’equilibrio acido-base: acidosi metabolica, acidosi respiratoria, alcalosi metabolica, alcalosi respiratoria e relative compensazioni fisiologiche. 
BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA
 *ArgomentiRiferimenti testi
1*I campioni biologici, estrazione e dosaggio di acidi nucleici e proteine.1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 5)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
2*Tecniche di biologia molecolare in laboratorio: Reazione di polimerizzazione a catena (PCR), 1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 5)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docent 
3 Applicazioni in campo odontoiatrico della PCRMateriale fornito durante il corso dalla docente 
4 Saggi immunoenzimatici (ELISA),Materiale fornito durante il corso dalla docente 
5  Sequenziamento I, II, IIIMateriale fornito durante il corso dalla docente 
6 Tecnologie MicroarraysMateriale fornito durante il corso dalla docente 
7*Marcatori Tumorali, tumori del cavo oraleMateriale fornito durante il corso dalla docente 
BIOCHIMICA CLINICA
 *ArgomentiRiferimenti testi
1*Definizione e ruolo della Medicina di Laboratorio, l’indagine di laboratorio1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente.  
2*I campioni biologici: tipi, prelievi, trattamento e conservazione. 1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente.  
3*Il referto biologico: variabilità preanalitica, analitica e post-analitica. Variabilità biologica. Il controllo di qualità. Caratteristiche diagnostiche di un test di laboratorio: la sensibilità diagnostica, la specificità diagnostica, valore predittivo positivo e negativo di un test, la finestra diagnostica1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
4*Il Fegato, metabolismo, marcatori di lesione epatica. 1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
5*Sintesi e catabolismo dell'eme, gli itteri1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
6 Detossificazione da alcol e farmaci. Lipoproteine plasmatiche. Ciclo dell'urea1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente.  
7*Attività metabolica della placca dentale, carie e tartaro1)Biologia del cavo orale. Istologia, biochimica, fisiologia, David B. Ferguson, CEA; 2)Biochimica medica strutturale metabolica e funzionale, Noris Siliprandi,Guido Tettamanti, Piccin-Nuova Li 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
8*Metabolismo del Calcio e del fosfato.1)Biologia del cavo orale. Istologia, biochimica, fisiologia, David B. Ferguson, CEA; 2)Biochimica medica strutturale metabolica e funzionale, Noris Siliprandi,Guido Tettamanti, Piccin-Nuova Li 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
9*Il Cuore, Marcatori di danno cardiaco, Indagini di laboratorio1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
10 Rischio cardiovascolare: aterosclerosi e metabolismo lipidico, Indagini di laboratorio.1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
11*Il Rene: Parametri per la valutazione della funzionalità renale ed esame delle urine1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
12*L'esame emocromocitometrico, VES1)Medicina di Laboratorio e Diagnostica Genetica, L. Sacchetti, et al. Idelson-Gnocchi. 2)Medicina di Laboratorio, M. Zatti, et al., Idelson-Gnocchi. 3)Materiale didattico fornito durante il corso dalla docente. 
* Conoscenze minime irrinunciabili per il superamento dell'esame.

N.B. La conoscenza degli argomenti contrassegnati con l'asterisco è condizione necessaria ma non sufficiente per il superamento dell'esame. Rispondere in maniera sufficiente o anche più che sufficiente alle domande su tali argomenti non assicura, pertanto, il superamento dell'esame.

Verifica dell'apprendimento

Modalità di verifica dell'apprendimento

  • BIOCHIMICA

    Prova Orale

  • BIOLOGIA MOLECOLARE

    Colloquio Orale

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    Esame orale

  • BIOCHIMICA CLINICA

    Esame Orale


Esempi di domande e/o esercizi frequenti

  • BIOCHIMICA

    1. Catena Respiratoria mitocondriale

    2. Fosforilazione ossidativa.

    3. Ciclo di Krebs e sua regolazione. Correlazione con lipogenesi e sua regolazione.

    4. Lipogenesi

    5. Regolazione della chetogenesi. Chetoacidosi diabetica.

    6. Emoglobina e tamponi emoglobinici

    7. Gluconeogenesi.

    8. Ormoni e loro meccanismo d’azione: Insulina e suoi recettori. Meccanismo d’azione degli ormoni glucocorticoidi.

    9. Ciclo extramitocondriale del citrato.

    10. Biochimica renale: Aldosterone, ADH – Teoria di moltiplicazione in controcorrente.

  • BIOCHIMICA CLINICA E BIOLOGIA MOLECOLARE CLINICA

    Tecniche di biologia molecolare,

    Reazione di polimerizzazione a catena (PCR), Saggi immunoenzimatici, Sequenziamento I, II e III generazione, microarrays

  • BIOCHIMICA CLINICA

    Significato della finestra diagnostica, Valore Predittivo positivo e negativo, sensibilità e specificità diagnostica

    Indici emocromocitometrici

    Alterazioni biochimiche relative al metabolismo del cavo orale, carie e tartaro

    Valutazioni di marcatori biochimici nell'infarto del miocardio